2007年项目建设指挥部党支部成立，2014年国家科学中心党总支成立，2021年8月中国共产党百盈彩票app百盈彩票app委员会成立。目前由4个教工党支部和7个研究生党支部组成，共有共产党员190人（教职工党员70人、研究生党员120人）。

党委书记：夏秀芹

党委副书记：梁治国、邰晓东

党委委员：陆永浩、阳建宏（金属冶炼基地）、章立军、杨超华、艾轶博

4个教工党支部：

科技创新党支部、实验技术党支部、技术管理党支部、金属冶炼基地党支部

7个学生党支部：

国科博1617党支部、国科博19党支部、国科博2021党支部、国科博22党支部、国科硕20党支部、国科硕21党支部、国科硕22党支部